次日，奉天门，一套繁锁的礼节过后，太仆寺卿赵南星在文官班子里轻咳一声，从文官班子里走出，道：“臣太常寺卿赵南星有事奏启陛下。”
“平身，奏来！”朱由校道。
“臣闻九边久欠饷银，臣请陛下发內帑，补发边卒所欠之响，以慰军心。”赵南星叩头道。
“呵呵！”朱由校发出冷笑，向赵南星道：“爱卿言之有理，朕和二位阁老商议后再说。”
“臣请陛下乾纲独断！”赵南星叩头道。他们几个在北京的的东林党商业派人士在昨晚的意思，继续巧立名目，花掉朱由校的內帑，迫使皇帝交权，这还是汪文言得主意，另一个就是和江南巨贾大户们一起打击“北货”，使皇帝陷入坐吃山空的窘境，还有一个就是逼皇帝废掉宝和店，断掉皇帝的财路。
底下呼啦啦跪倒一大片，皆道：“请陛下乾纲独断。”朱由校一看，都是几个“地主派”的头头的学生，他们见坐师跪了，自己当然要跪。
朱由校看到“地主派”的人这么多，心中动了杀机，也不顾什么大臣的脸皮不脸皮，直接道：“朕从王公公处知晓，九月，皇父便发帑三百万，发给九边巡抚按官，让他们犒赏将士；并拨给运费五千两白银，沿途支用。皇父还专门强调，银子解到后，立刻派人下发，不得擅自入库挪为它用，赵大人，汝忘了？还是，汝，贪，了？”
赵南星冷汗一下就下来了，贪，他确实贪了，但这个可不敢说，说出去不仅他完蛋，东林也得跟着凉凉，那帮地主巨贾饶不了他！他立刻大声道：“臣未贪，请陛下勿听阉寺奸邪之言！”
“呵呵！”朱由校对此抱以同样的笑声，劳资不用家奴用你们？再进水一回吗？
“朕曾听过一故事，叫‘三人成虎’，不知赵南星你可听过，没听过也没关系，朕给你讲讲：庞葱要陪太子到邯郸去做人质，庞葱对魏王说：“现在，如果有一个人说大街上有老虎，您相信吗”“魏王说：“不相信。”庞葱说：“如果是两个人说呢？”魏王说：“那我就要疑惑了。”庞葱又说：“如果增加到三个人呢，大王相信吗？”魏王说：“我相信了。所以这个故事让朕得到了八个字——耳听为虚，眼见为实，所以啊，朕不信汝的说辞，忠贤！”
“老奴在！”魏公公在一旁躬身道。
“给朕查！好好查，细细查！”朱由校笑道。
赵南星冷汗刷刷的往外直冒。
“赵大人，如果查实……咱就按祖制办！”朱由校慢慢道。
“退朝！”朱由校摆摆手，慢慢的走出奉天门，也不理会这些跪着的文臣，各位慢慢跪罢！
“王安！去请英国公张维贤，恭顺侯吴惟英，唐王朱器墭，兵部尚书兼武英殿大学士孙承宗入朝。”朱由校回到乾清宫后道。
“老奴遵旨！”王安急匆匆的出了门。
朱由校打算构造大明的总参谋部，跟普鲁士的差不多，这么干的原因，就是要军改！
大明卫所制是以蒙古千户制为范本而弄出的，在明初，对国家发展提供了很大的助力，所以朱元璋就说：“吾国养兵百万，而不费朝廷一钱。”但现在，户所兵基础上是依附在军官手上的农奴，吃不好，穿不好，操练基本上没有，青壮少而老弱多，指望这些人打胜仗，那纯粹是在做白日梦。
朱由校叫来的这几人，英国公和恭顺侯两人都跟大明干到了死，唐王朱器墭是后来隆武帝的老爹，他的老爹老唐王“惑于嬖人”，把他与他的儿子朱聿键（后来的隆武帝）一起被囚，后来老唐王被朱由校斩于菜市口，这位被朱由校从囚室给拉出来，算是对朱由校最忠诚的藩王了。
过了一阵，朱由校来到文华殿，几人行过礼后，朱由校道：“本朝边饷拖欠严重，再不发，朕恐酿出大祸，但边军贪污甚重，吃空饷问题屡禁不止，各卿有何办法，说来听听。”
张维贤作为大明军方第一人，首先道：“臣久于五军都督府任职，军户实额与账面上相差甚大，臣建议派人去核对数目，可先查八边，再发饷银（辽东镇被朱由校给查过了）。”
“英国公言之有理。”孙承宗作为文官中军方第一大佬，道：“臣以为，欲整九边，先整蓟镇，欲查蓟镇，先查京师，三大营空有其表，末有其实，神机营连火铳也不会放，不如先严整三大营！”
几人都点点头称是。
朱由校道：“先生可有人选？”
孙承宗道：“臣有人选二人，马世龙，戚金！”
“就让他们去！”朱由校道：“戚金整兵，世龙肃将！朕以为，可立一部门，专做此事，各位爱卿且听一听。”
几人马上附耳恭听。朱由校道：“朕以为这个部门主要职责是：负责军队的组织、训练、动员。
用有经验的将官，将这个部门建设成为一个培养军队精英和研究战争经验的学校。
朕规定，从事该部勤务的军官必须在普通军事学校学习三年，在测绘局工作三年，夏季从事野外测绘勤务，冬季从事军事科学工作。
要设一个军事科学处，集中所有懂得测量、统计、地形测绘专家，为军队提供服务，发展新技术。
这些赞画将成为元帅的大脑，朕在萨尔浒战役就深有感触，当时为朕参谋战争的有茅元仪，孙先生，熊廷弼等人，朕正是听了他们的意见，方才在第一次作战便打胜了久征沙场老奴。”
孙承宗听到这里，点头称是。对此很是骄傲。
朱由校接着道：“朕再设一军需部，也归此部门所辖，朕在辽东时，火炮等等，早前皆朽坏，不堪使用，朕将所有军备皆重铸方才变好。所以，这军需部必须要设。该部门，叫总参谋部部。各位爱卿，对此有何意见？”
“小王敢问陛下，这些军官从何而来？”唐王道。
“从军校来！”